Ancienne abbaye bénédictine fondée au Ve siècle par la reine Clotilde, l'abbaye Saint-Germain d'Auxerre est depuis ses origines la nécropole des évêques d'Auxerre. Celle qui connut son heure de gloire au IXe siècle en accueillant l'école d'Auxerre, l'un des centres de la Renaissance carolingienne, est encore aujourd'hui un ensemble architectural de grand intérêt.
Classée aux Monuments Historiques, elle dévoile notamment à ses visiteurs de très belles cryptes carolingiennes du IXe siècle décorées de peintures murales faisant partie des plus anciennes de France. Elles représentent notamment la lapidation de saint Étienne et l'Extase.
Les visiteurs peuvent aussi découvrir l'église abbatiale gothique, la salle du chapitre du XIIe siècle, le cellier du XIVe ou encore le cloître reconstruit au XVIIe siècle dans un style classique. La tour de Saint-Jean du XIIe siècle, qui surplombe tous les bâtiments de sa flèche de pierre à huit pans convexes, mérite également l'arrêt.
L'abbaye Saint-Germain d'Auxerre accueille également un très intéressant musée d'art et d'histoire témoignant du passé de la ville et de sa région de la Préhistoire à la fin du Moyen Âge. L'occasion de découvrir notamment le Suaire de Saint-Germain, un tissu byzantin de l'an mil, ou encore le Cheval de Guerchy.
Pour compléter cette importante offre culturelle, le site accueille régulièrement des expositions temporaires thématiques.
